因此，戊二醛对超微结构细节的保存能力更胜于甲醛，且在固定后的漂洗环节，标本的固定效果能继续保持稳固。除了染色环节，戊二醛还可能影响切片。戊二醛固定的标本，由于交联更稳固，宏观上表现为韧性更强，质地更致密。



在后续脱水、浸蜡等操作中，标本的硬化程度通常更高，渗透速度会更慢。如果批量操作中不加注意，戊二醛固定的标本，很可能成为一批当中难切的一类。在需要进行免疫反应的实验中，戊二醛浓度超过0.5%时，通常会显著破坏大多数抗原的检出灵敏度。对光镜观察可能破坏有效的免疫检测，在光镜免疫化学实验中，不用戊二醛。

戊二醛以戊二醛为主要原材料调制而成
戊二醛液是一种新型、低毒的中性强化消毒液，可杀灭细菌繁殖体、细菌芽孢、肝炎病毒等病原微生物。戊二醛有广谱的杀灭微生物能力，2%的碱性戊二醛溶液两分钟可杀灭繁殖体，10 分钟可杀灭病毒，20 分钟可杀灭分枝杆菌，3 小时可杀灭细菌芽胞； 因此戊二醛可作为一种高水平消毒剂，如果暴露时间( 10 小时) 足够，也可作为灭菌剂使用；国外戊二醛的初始浓度原则上要高于2%，如用于消毒，暴露时间不低于20 分钟，如用于灭菌，则暴露时间10 小时；由于在使用过程中很多因素会引起戊二醛浓度的降低：如碱性戊二醛的聚合、水的稀释、使用频率、消毒液挥发和丢失等，因此必须每天对戊二醛的浓度加以监测。 



戊二醛主要通过其两个活泼的醛基来杀灭微生物；其活性受pH 和温度等因素的影响; 戊二醛在酸性条件下， 其单体水解成一水化合物、二水化合物， 环状的半乙缩醛和类似乙缩醛的多聚体，它们之间相互平衡； 由于酸性水溶液中只存在少量的戊二醛单体， 因此其生物活性较差；但在酸性条件下， 戊二醛的聚合作用较慢，这样酸性戊二醛较稳定，可储存较长的时间。