在酸性条件下，提高温度可产生更多的自由醛基，从而提高其生物学活性。戊二醛在pH7. 5～8. 5 碱性条件下，其生物活性较高，可杀灭包括芽胞在内的所有微生物戊二醛在碱性条件下可以聚合成丁间醇醛型不饱和多聚体，再形成更高的聚合形式; 在碱性水溶液中，戊二醛的聚合作用是不可逆的，随着聚合体的逐渐增多，其活性逐渐减弱或消失；碱性戊二醛随pH 和温度提高，存放时间延长，均可导致聚合作用加强，从而加快其活性降低。因此碱性戊二醛活性较强，但有效期一般只有两周；酸性戊二醛活性较弱，但有效期较长， 可达1 个月。



戊二醛消毒剂以戊二醛为主要原材料，配以适量的增效表面活性剂调制而成。 戊二醛消毒液多用于诊疗器械、化妆品业、电子工业、宾馆业、卫生用品等行业环境和物品的灭菌。对于耐热和耐湿的物品可选用压力蒸气和干热灭菌，不耐热和耐湿的物品可选用环氧乙烷气体灭菌。 如只能选择戊二醛灭菌，灭菌后的医疗器械必须用无菌蒸馏水( 生理盐水可能有腐蚀性) 漂洗干净。医疗产品在消毒与灭菌前，必须被清洗干净；清洗后，必须干燥后方能浸入戊二醛溶液，以免造成对戊二醛的稀释。 



含量的戊二醛溶液，这种溶液不能直接使用，需要稀释并加入其他表面活性剂等材料混合而成戊二醛消毒液。

因此，戊二醛对超微结构细节的保存能力更胜于甲醛，且在固定后的漂洗环节，标本的固定效果能继续保持稳固。除了染色环节，戊二醛还可能影响切片。戊二醛固定的标本，由于交联更稳固，宏观上表现为韧性更强，质地更致密。



在后续脱水、浸蜡等操作中，标本的硬化程度通常更高，渗透速度会更慢。如果批量操作中不加注意，戊二醛固定的标本，很可能成为一批当中难切的一类。在需要进行免疫反应的实验中，戊二醛浓度超过0.5%时，通常会显著破坏大多数抗原的检出灵敏度。对光镜观察可能破坏有效的免疫检测，在光镜免疫化学实验中，不用戊二醛。